Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 18-34-00348\18

УДК 577.21:582.475.2
AGRIS F30        

http://doi.org/10.5281/zenodo.2255147

АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ И СТРУКТУРЫ

ПОПУЛЯЦИЙ ЗАПАДНОЙ РАСЫ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ LARIX SIBIRICA LEDEB. УРАЛА

НА ОСНОВЕ ПОЛИМОРФИЗМА МЕЖМИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ

©Васильева Ю. С., ORCID: 0000-0002-2255-2434, канд. биол. наук, Пермский государственный

национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, yulianechaeva@mail.ru
©Пришнивская Я. В., ORCID: 0000-0003-1513-2682, Пермский государственный

национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, yana_prishnivskaya@mail.ru
©Чертов Н. В., Пермский государственный национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, syper.gall@mail.ru
©Жуланов А. А., Пермский государственный национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, aumakua.ru@gmail.com

 

Аннотация. Сохранение генетического разнообразия вида возможно только при условии сохранения генофонда его популяций. Особенно важны исследования закономерностей распределения генетической изменчивости для видов, занимающих обширные ареалы и имеющих хозяйственное значение, таких как виды рода Larix Mill. Целью данного исследования является анализ генетического разнообразия и структуры некоторых популяций L. sibirica Урала на основе полиморфизма межмикросателлитных маркеров. С использованием ISSR–маркеров проведен анализ генетического разнообразия и структуры 6 природных популяций лиственницы сибирской L. sibirica на Урале. В результате анализа выявлено 120 ISSR–маркеров, из которых 116 были полиморфными (Р95=0,967). Определены основные параметры генетического разнообразия популяций и показано, что уральские популяции лиственницы сибирской характеризуются более высоким генетическим разнообразием. При этом самые высокие показатели генетического разнообразия отмечены в популяции VSN (P95=0,923; HE=0,236; ne=1,388), а наименее разнообразной по всем показателям оказалась популяция ISH (P95=0,826; HE=0,191; ne=1,321). Изученные популяции L. sibirica Урала в значительной степени дифференцированы, большая часть всего наблюдаемого генетического разнообразия сосредоточена внутри популяций. Структура популяций в целом близка, но не в полной мере отражает географическое расположение изученных популяций. Полученные данные свидетельствуют о существовании генетически дифференцированных популяций и их групп у L. sibirica в регионе исследования, и будут важны для разработки эффективной стратегии сохранения и воспроизводства ценных древесных видов растений.

 

Ключевые слова: генетическое разнообразие, генетическая структура, ISSR-маркеры, Урал, Larix sibirica.

 

Ссылка для цитирования:

Васильева Ю. С., Пришнивская Я. В., Чертов Н. В., Жуланов А. А. Анализ генетического разнообразия и структуры популяций западной расы лиственницы сибирской Larix sibirica Ledeb. Урала на основе полиморфизма межмикросателлитных маркеров // Бюллетень науки и практики. 2018. Т. 4. №12. С. 113-124. Режим доступа: http://www.bulletennauki.com/12-14 (дата обращения 15.12.2018).

 

ANALYSIS OF GENETIC DIVERSITY AND STRUCTURE OF URALS POPULATIONS OF WESTERN RACE

OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) BASED ON INTERMICROSATELLITE MARKERS POLYMORPHISM

©Vasileva Yu., ORCID: 0000-0002-2255-2434, Ph.D., Perm State University, Perm, Russia, yulianechaeva@mail.ru
©Prishnivskaya Ya., ORCID: 0000-0003-1513-2682, Perm State University, Perm, Russia, yana_prishnivskaya@mail.ru
©Chertov N., Perm State University, Perm, Russia, syper.gall@mail.ru
©Zhulanov A., Perm State University, Perm, Russia, aumakua.ru@gmail.com

 

Abstract. The preservation of the genetic diversity of a species is possible only if the gene pool of its populations is preserved. Particularly important are studies of patterns of distribution of genetic variability for species that occupy vast areas and are of economic importance, such as species of the genus Larix Mill. The purpose of this study is to analyze the genetic diversity and structure of some populations of L. sibirica of Ural based on intermicrosatellite polymorphism. Using the ISSR markers, the genetic diversity and structure of 6 natural populations of Siberian larch L. sibirica in the Urals were analyzed. The analysis revealed 120 ISSR markers, of which 116 were polymorphic (P95=0.967). The main parameters of the genetic diversity of populations were determined and it was shown that the Ural populations of Siberian larch are characterized by a higher genetic diversity. At the same time, the highest rates of genetic diversity were found in the VSN population (P95=0.923; HE=0.236; ne=1.388), while the ISH population was the least diverse in all indicators (P95=0.826; HE=0.191; ne=1.321). The studied populations of L. sibirica of the Urals are largely differentiated, most of the entire observed genetic diversity is concentrated within populations. The structure of populations is generally close but does not fully reflect the geographical location of the studied populations. The findings suggest the existence of genetically differentiated populations and their groups in L. sibirica in the study region and will be important for the development of an effective strategy for the conservation and reproduction of valuable tree species of plants.

 

Keywords: genetic diversity, genetic structure, ISSR markers, Ural, Larix sibirica.

 

Cite as (APA):

Vasileva, Yu., Prishnivskaya, Ya., Chertov, N., & Zhulanov, A. (2018). Analysis of genetic diversity and structure of Urals populations of Western Race of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) based on intermicrosatellite markers polymorphism. Bulletin of Science and Practice, 4(12), 113-124. (in Russian).