Печенкина В. А., Жуланов А. А., Пришнивская Я. В., Васильева Ю. С., Бо

УДК 575.22:577.29

AGRIS: F30

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ОТЕЧЕСТВЕННЫХ СОРТОВ SOLANUM TUBEROSUM L.

©Печенкина В. А., ORCID: 0000-0003-4241-4482

Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия, p_viktoria2@mail.ru
©Жуланов А. А., ORCID: 0000-0003-2546-9350

Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия, aumakua.ru@gmail.com
©Пришнивская Я. В., ORCID: 0000-0003-1513-2682

Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия, yana_prishnivskaya@mail.ru
©Васильева Ю. С., канд. биол наук, ORCID:0000-0002-2255-2434
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия, Yulianechaeva@mail.ru
©Боронникова С. В., д- р биол. наук, ORCID: 0000-0002-5498-8160
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия, SVBoronnikova@yandex.ru

Аннотация. Исследованы характеристики 12 сортов картофеля (Solanum tuberosum L., Solanaceae) российского происхождения. Урожайность изученных сортов высока и варьирует в пределах от 25 до 40 т/га; среднее содержание крахмала в клубнях достигает 16%, средняя масса клубней — не менее 10 г. Среди 12 изученных 6 сортов S. tuberosum являются среднеспелыми и 6 — раннеспелыми. Для определения генетического разнообразия сортов S. tuberosum был применен ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) — метод анализа полиморфизма ДНК с использованием ПЦР. Из 20 ISSR-праймеров были отобраны 4 наиболее эффективных для изученных сортов S. tuberosum, среди которых два динуклеотидных и два трехнуклеотидных праймера. У изученных сортов установлены 40 ISSR-PСR маркеров. Число амплифицированных ISSR-PCR маркеров S. tuberosum варьировало в зависимости от праймера от 8 (праймер ISSR-5) до 12 (праймер M3) а их размеры — от 210 (ISSR-5) до 1100 (X11) пн. На общую выборку S. tuberosum доля полиморфных локусов составила 0,575, ожидаемая гетерозиготность равна 0,071, определено число эффективных аллелей (ne=1,324). Наибольшие показатели генетического разнообразия отмечены у сорта Чародей S. tuberosum (P95=0,303; HE=0,105; ne=1,189). Генетически менее гетерогенен сорт Отрада (P95=0,161; HE=0,047; ne=1,079). У изученных сортов картофеля выявлено 9 редких ISSR-PCR маркеров, наибольшее их число выявлено у сорта Чародей (R=6). Даны рекомендации по использованию генетического потенциала изученных сортов S. tuberosum.

Ключевые слова: ISSR-PCR маркеры, полиморфизм ДНК, отечественный сорт, Solanum tuberosum L.

Ссылка для цитирования:

Печенкина В. А., Жуланов А. А., Пришнивская Я. В., Васильева Ю. С., Боронникова С. В. Молекулярно-генетический анализ отечественных сортов Solanum tuberosum L. // Бюллетень науки и практики. 2018. Т. 4. №3. С. 11-19. Режим доступа: http://www.bulletennauki.com/pechenkina (дата обращения 15.03.2018). DOI:10.5281/zenodo.1197620

MOLECULAR-GENETIC ANALYSIS OF NATIONAL VARIETIESOF SOLANUM TUBEROSUM L.

©Pechenkina V., ORCID: 0000-0003-4241-4482 Perm State University, Perm, Russia, p_viktoria2@mail.ru

©Zhulanov А., ORCID: 0000-0003-2546-9350 Perm State University, Perm, Russia, aumakua.ru@gmail.com

Abstract. Trails of 12 varieties of Russian origin Potato (Solanum tuberosum L., Solanaceae), were observed. The yield of researched varieties is high and ranges from 25 to 40 t./ha.; mean concentrations of starch in tubers is 16%, the average mass of tubers is more than 10 g. Among the researched varieties 6 varieties of S. tuberosum are a mid-season high-yield, other 6 varieties are early–ripe. ISSR (Inter-Simple Sequence Repeats) method of polymorphism analysis with using PCR was applied to identify the genetic diversity of varieties. From 20 were selected 4 the most effective ISSR praimers for researched varieties of S. tuberosum, among it there are two dinucleotide and two trinucleotide primers. 40 ISSR-PCR markers of researched varieties were identified. The number of amplified ISSR-PCR markers of S. tuberosum varied depending to primer from 8 (ISSR-5) to 12 (M-3), their size were from 210 (ISSR-5) to 1100 (M-3) bp. For the total sample of S. tuberosum, the proportion of polymorphic loci was 0,575, the expected heterozygosity was 0.071, the number of effective alleles (ne=1.324) was determined. The highest rate of genetic diversity was noted in Charodei S. tuberosum (P95=0.303; HE=0.105; ne=1.189). Genetically less heterogeneous Otrada (P95=0.161; HE=0.047; ne=1.079). 9 rare ISSR-PCR markers in researched varieties were identified, the largest number of them has Charodei (R=6). Recommendations on the use of the genetic capability in researched varieties of S. tuberosum were made.

Keywords: ISSR-PCR markers, DNA polymorphism, domestic varieties, Solanum tuberosum L.

Cite as (APA):

Pechenkina, V., Zhulanov, А., Prishnivskaya, Ya., Vasilieva, Yu., & Boronnikova, S. (2018). Molecular-genetic analysis of national varieties of Solanum tuberosum L. Bulletin of Science and Practice, 4, (3), 11-19 doi:10.5281/zenodo.1197620

БЮЛЛЕТЕНЬ НАУКИ И ПРАКТИКИ

BULLETIN OF SCIENCE AND PRACTICE

научный электронный журнал

Scientific Journal